负责全区传染病预防与控制，制定重点传染病的预防控制规划、计划、方案，并组织实施；承担全区传染病疫情收集、整理、分析、研判、报告、调查处置等，对传染病的发生流行进行调查处理，为救灾防病和解决重大公共卫生问题提供技术支持；负责基层传染病预防与控制业务的技术指导、培训，业务考评工作；承担疾病预防控制及有关公共卫生信息的报告、管理和预测、预报，为疾病预防控制决策提供科学依据。

建立完善全区重大疫情和中毒事件应急体系；制订年度应急业务工作目标和技术发展计划，并组织实施和管理，提高应急工作能力；负责重大疫情和中毒事件应急处置的日常业务管理工作，组织、协调重大应急事件的调查和处理；负责各类突发公共卫生事件信息报告、应急处置工作。

及时了解国内外重大疫情、新发传染病、生物化学危害、职业中毒、食源性疾病及环境污染等信息与动态。负责与上级业务部门的相关业务工作联系和中心内部有关科室的应急业务工作协调；做好应急值班记录及有关资料积累和档案整理。负责应急处置队伍和应急物资的储备管理。负责全区基层医疗卫生机构开展突发公共卫生事件应急演练和应急技能培训，指导基层医疗机构开展突发公共卫生事件的现场处置。